现代医学对于前列腺结石的病因机制还不是很明确，医学家有以下几种看法。一种观点认为前列腺结石是围绕一个有机物核心，象滚雪球一样逐渐增大的。有机物核心经常是血块、细菌、坏死组织或一种叫“淀粉样体”的物质。
淀粉样体是由脂肪、核蛋白、晶体嘌呤、胆固醇等包绕脱落的上皮而形成的一个小的圆形或椭圆形的放射状结构的物体。尿液流经尿道时，可从前列腺管口反流到远端的前列腺管，尿中的钙盐结晶可逐层沉积于有机物核心上，逐渐增大，形成结石。
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