还有大约10%的患者属于器质性不射精，治疗则相当困难。如（1）大脑侧叶病变；（2）脊髓胸12-腰1段及骶髓段损伤；（3）传导神经障碍如施行胸腰交感神经切除术或腹膜后淋巴结清扫术都能损伤神经造成不射精；（4）局部病变如膀胱颈松弛；（5）其他如垂体功能低下、甲亢、肢端肥大症、黏液水肿等也能引起射精障碍；（6）医源性原因如药物影响。

多数功能性不射精在清醒状态下从未射过精，但平时有遗精现象，而且在手淫时或由女方用手或口等非性交刺激则能射精，称为选择性不射精症。这是无意识性抵触或性交时刺激程度不够，射精反射未“接通”或是没有达到能引起反射强度的缘故。如有些男子从小的手淫方式系压迫阴茎而不是摩擦阴茎，婚后性交的刺激方式与过去完全不同，结果他们无法在性交时射精。也有的男子婚后曾有过射精，但后来因采用体外排精避孕、婚外性交被人发现并受责罚、对妊娠的恐惧心理等各种因素的消极影响而最终导致不射精。

功能性不射精是射精障碍中最多见的一型，约占病例数的90%以上，它包括（1）中枢性射精障碍-----大脑功能异常，对射精中枢抑制加强，患者无性高潮和射精动作。少数病例因感受器官、感情、智障等造成不射精。（2）脊髓性射精障碍----腰骶髓内射精中枢功能紊乱导致射精迟缓或不射精。（3）心理性射精障碍，纯粹因心理因素所致。

有少数男子因不育症前来求治，经询问后才得知他们患有不射精症，他们的阴茎可以毫无困难地勃起，性交时间能维持很久而不疲软，只是不能达到性高潮或射精，当然也谈不上生育了。所以，他们的不育完全是不射精这种性功能障碍导致的。由于这种性功能障碍主要见于青壮年，而且关系到生育问题，处理不当很容易影响夫妻感情，甚至导致家庭破裂，给病人带来精神上的苦恼。不射精症分为功能性和器质性两类：